Objectifs

1. Permettre à l'étudiant d'acquérir des connaissances fondamentales en biophysique, tant théoriques que pratiques, qui lui serviront de base pour l'étude d'autres matières du cursus de licence en biotechnologie.

2. Se familiariser avec les notions mathématiques de base utilisées en physique.

3. Découvrir les caractéristiques et les propriétés du mouvement.

4. Découvrir les propriétés et les interactions des différents types de fluides.

5. Apprendre les principes fondamentaux de la thermodynamique.

6. Connaître les propriétés et les particularités des ondes et des rayonnements.

7. Découvrir les concepts de base et les applications de l'électromagnétisme et de l'électricité.

8. Approfondir ses connaissances sur la radioactivité et ses implications pour l'être humain.

9. Connaître les phénomènes de transport dans les systèmes biologiques.

Compétences

COMPÉTENCES DE BASE

CB1 : Les étudiants doivent avoir démontré qu’ils possèdent et comprennent des connaissances dans un domaine d’étude qui s’appuie sur les bases de l’enseignement secondaire général et se situe généralement à un niveau qui, bien qu’il s’appuie sur des manuels avancés, inclut également certains aspects nécessitant des connaissances issues de la pointe de leur domaine d’étude.

CB2 : Que les étudiants sachent appliquer leurs connaissances à leur travail ou à leur vocation de manière professionnelle et possèdent les compétences qui s’expriment généralement par l’élaboration et la défense d’arguments ainsi que par la résolution de problèmes dans leur domaine d’étude.

CB3 : Que les étudiants soient capables de collecter et d’interpréter des données pertinentes (généralement dans leur domaine d’étude) afin de formuler des jugements incluant une réflexion sur des questions pertinentes d’ordre social, scientifique ou éthique.

CB4 : Que les étudiants soient capables de transmettre des informations, des idées, des problèmes et des solutions à un public tant spécialisé que non spécialisé.

CB5 : Que les étudiants aient développé les aptitudes d’apprentissage nécessaires pour entreprendre des études supérieures avec un haut degré d’autonomie.

COMPÉTENCES GÉNÉRALES

CG1 – Penser de manière intégrée, raisonner de manière critique et aborder les problèmes sous différents angles.

CG2 – Savoir obtenir, traiter, interpréter, analyser et synthétiser des informations et des résultats pertinents, et tirer des conclusions sur des thèmes liés à la biotechnologie.

CG4 - Interpréter des résultats expérimentaux et identifier les éléments cohérents et incohérents.

CG5 – Appliquer les connaissances théoriques et pratiques acquises à la formulation de problèmes et rechercher des solutions de manière efficace et créative, tant dans des contextes professionnels qu’académiques.

CG6. – Étudier et apprendre de manière autonome, en organisant et en planifiant son travail, et acquérir la capacité de travailler en équipe ainsi que la confiance en soi.

COMPÉTENCES SPÉCIFIQUES :

CE1. – Connaître et comprendre les concepts fondamentaux des mathématiques, de la physique, de la chimie et de la biologie, ainsi que les principaux outils utilisés dans ces disciplines pour la recherche et le développement de procédés biotechnologiques.

CE6.- Savoir utiliser les méthodes mathématiques, statistiques et informatiques essentielles à l’étude, à l’interprétation et au contrôle d’expériences ou de procédés biotechnologiques.

Résultats d’apprentissage

- Savoir appliquer les connaissances de base en physique à la biotechnologie.

- Résoudre des problèmes liés au champ électrique et comprendre leur relation avec les systèmes biologiques et les systèmes de mesure.

- Applications pratiques de la statique et de la dynamique des fluides.

- Appliquer les concepts et les lois fondamentales de la mécanique des fluides à l'étude des fluides biologiques.

-Appliquer les connaissances de base relatives au concept de champ : champs gravitationnel, électrique et magnétique, ainsi qu’aux forces et potentiels associés.

- Identifier les propriétés électriques des milieux matériels et leur application à l’étude des phénomènes biologiques.

-Analyser la réponse de la matière aux champs électromagnétiques et ses applications spectroscopiques.

- Identifier les processus de désintégration radioactive et leurs applications biologiques.

-Réaliser des expériences simples sur les phénomènes abordés dans le programme de la matière : utilisation des instruments appropriés, analyse des données et des résultats.

Description des contenus

INTRODUCTION

THÈME 1. LE LANGAGE DE LA PHYSIQUE :

Ordres de grandeur et échelles. Unités et systèmes de mesure. Grandeurs scalaires et vectorielles. Vecteurs.

THÈME 2. MÉCANIQUE :

CINÉMATIQUE : MRU, MRUA, MC et MAS.

DYNAMIQUE : Forces et lois de Newton. Moment linéaire et moment angulaire d’une force. Impulsion. Travail et énergie. Lois de conservation.

THÈME 3. PHYSIQUE DES FLUIDES :

HYDROSTATIQUE : pression hydrostatique, atmosphérique et manométrique. Principe fondamental de l’hydrostatique. Principe de Pascal. Principe d’Archimède.

HYDRODYNAMIQUE : Régime laminaire et turbulent. Débit volumique. Loi de continuité. Théorème de Bernoulli. Membranes biologiques et pression osmotique.

THÈME 4. THERMODYNAMIQUE :

États de la matière. Propriétés des solides, des liquides et des gaz. Conduction, convection et rayonnement. Principe zéro. Température et échelles de température. Premier principe de la thermodynamique. Processus thermodynamiques. Potentiels. Énergie interne et enthalpie. Chaleur et énergie thermique. Travail et énergie physique. Réchauffements, refroidissements et changements d’état. Capacité thermique, chaleur spécifique et chaleur latente. Deuxième principe de la thermodynamique. Entropie. Troisième principe de la thermodynamique. Zéro absolu.

THÈME 5. CHAMPS ET ONDES :

Ondes mécaniques et électromagnétiques. Acoustique et optique. Oscillations. Cinématique et dynamique des systèmes mécaniques simples. Couplage des systèmes mécaniques simples. Résonance.

THÈME 6. CHAMPS ÉLECTROMAGNÉTIQUES :

ÉLECTROSTATIQUE ET MAGNÉTISME : Charges électriques et lignes de champ. Potentiel, champ et force de Coulomb. Magnétisme. Dipôles magnétiques et induction.

ÉLECTRICITÉ : Composants actifs et passifs d’un circuit. Résistances, condensateurs, bobines. Circuits RC et RLC. Optoélectronique.

THÈME 7. BIOPHYSIQUE DU RAYONNEMENT : Physique quantique. Dualité onde-particule. Interaction rayonnement-matière. Spectroscopie. Radioactivité naturelle et artificielle. Effets de la radioactivité et protection contre celle-ci.

THÈME 8. PHÉNOMÈNES DE TRANSPORT : Transport à travers les membranes. Transport de matière. Lois de Fick. Transport de chaleur. Transport électrique. Cellules nerveuses et potentiels.

Activités pédagogiques

Cours magistral/Séances (SÉANCE dans le calendrier)

Travaux pratiques (LB dans le calendrier)

Séminaires/Travaux (TRAB dans le calendrier)

Tutorats/Consultations/Compléments aux cours magistraux (CN dans le calendrier)

Évaluation (EV dans le calendrier)

Étude personnelle

Système et critères d'évaluation

Sans préjudice de l'éventuelle définition d'une autre exigence dans le programme de cours correspondant, de manière générale, l'absence à plus de 70 % des activités pédagogiques du cours, nécessitant la présence physique ou virtuelle de l'étudiant, entraînera la perte du droit à l'évaluation continue lors de la session ordinaire. Dans ce cas, l’examen qui se tiendra pendant la période officielle fixée par l’université constituera le seul critère d’évaluation, avec la pondération qui lui correspond selon le programme de la matière.

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1. TYPES DE COURS :

1.1. La théorie et les exercices seront dispensés lors des cours de type « sessions d'exposé » et « sessions dynamiques » (SESION).

1.2 Nous travaillerons en équipe lors des cours de travaux pratiques (TRAB).

1.3 Nous effectuerons des travaux pratiques de LB afin de mettre en application les connaissances théoriques dans le laboratoire de physique (LB).

2. ÉVALUATION DU COURS :

2.1 La matière est validée avec une NOTE FINALE supérieure ou égale à 5, résultant des moyennes pondérées du point 2.2 :

0-4,99. Insuffisant

5-6,99. Passable

7-8,99. Bien

9-9,99. Très bien

10. Mention très bien

2.2 La matière peut être validée au cours de l'année soit par évaluation continue, soit lors de l'examen final.

2.2.1 ÉVALUATION CONTINUE :

La note finale du cours résulte de plusieurs éléments d’évaluation :

EXAMENS : Épreuves (30 % pour le premier examen partiel + 30 % pour le deuxième examen partiel) + Travaux pratiques (20 %)

AUTO-ÉVALUATIONS et TRAVAUX PRATIQUES : discussions et présentation théorique/pratique (travaux) : 15 %

PARTICIPATION, DISCUSSION ET PROPOSITIONS : 5 %

2.2.2 EXAMEN FINAL UNIQUE :

Si l'étudiant ne suit PAS régulièrement le cours ou s'il ne le réussit pas lors des examens partiels, il doit se présenter à l'examen final unique.

-Date : l’examen final aura lieu aux dates publiées par l’université, tant pour la session ordinaire que pour la session extraordinaire, et que vous pouvez consulter dans votre calendrier des examens.

-Type : Le type d’examen sera similaire à celui des examens partiels (voir ci-dessous).

-Contenu : l’ensemble du programme du cours.

3. Type d’examen.

-Les examens se dérouleront en présentiel à l'aide d'un seul appareil numérique, conformément au règlement de l'université.

-L'examen comportera deux parties, toutes deux sous forme de QCM : l'une consacrée à la théorie et l'autre à la résolution d'exercices numériques.

--THÉORIE : 10 questions à choix multiples de THÉORIE ou de THÉORIE APPLIQUÉE (3 points), avec plusieurs options de réponse, dont UNE SEULE est CORRECTE (+1 point/10 points) et les réponses incorrectes entraîneront une pénalité d'un tiers (-0,33 point).

--EXERCICES : 3 exercices numériques (10 points), similaires à ceux résolus lors des cours.

Ils sont présentés sous forme de test, à l’instar des questions théoriques ; les exercices numériques doivent être résolus par écrit de manière explicite sur une feuille qui vous sera fournie. Si l’exercice n’est pas résolu, il ne sera pas noté favorablement, même si la réponse cochée sur le formulaire est la bonne.

Calendrier

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Bibliographie

de base :

1.- Sears, Francis W.

Physique universitaire

6e éd. : Addison Wesley. 1988.

ISBN : 0201640139

2.- Villar, R., López, C., Cussó, F.

Fondements physiques des processus biologiques

Club Universitario. 2012.

ISBN : 9788415941385

Objectifs

1. Connaître et expliquer les principales caractéristiques structurelles des biomolécules.

2. Connaître et savoir mettre en œuvre les techniques expérimentales de base utilisées dans un laboratoire de biochimie.

3. S'exercer, sous supervision, aux techniques d'extraction et de purification des protéines.

4. Mettre en pratique, sous supervision, les techniques d'extraction et de purification des acides nucléiques.

Compétences

COMPÉTENCES DE BASE :

CB1 - Les étudiants doivent avoir démontré qu’ils possèdent et comprennent des connaissances dans un domaine d’étude qui s’appuie sur les bases de l’enseignement secondaire général et se situe généralement à un niveau qui, bien qu’il s’appuie sur des manuels avancés, inclut également

certains aspects nécessitant des connaissances issues de la pointe de leur domaine d’étude.

CB2 - Que les étudiants sachent appliquer leurs connaissances à leur travail ou à leur vocation de manière professionnelle et possèdent les

compétences qui se manifestent généralement par l’élaboration et la défense d’arguments ainsi que par la résolution de problèmes dans leur domaine d’étude.

CB3 - Que les étudiants soient capables de collecter et d’interpréter des données pertinentes (généralement dans leur domaine d’étude)

afin de formuler des jugements incluant une réflexion sur des questions pertinentes d’ordre social, scientifique ou éthique.

CB4 - Que les étudiants soient capables de transmettre des informations, des idées, des problèmes et des solutions à un public tant spécialisé que non

spécialisé.

CB5 - Que les étudiants aient développé les compétences d’apprentissage nécessaires pour entreprendre des études supérieures

avec un haut degré d’autonomie.

COMPÉTENCES GÉNÉRALES :

CG1 - Penser de manière intégrée, raisonner de façon critique et aborder les problèmes sous différents angles.

CG2 - Savoir obtenir, traiter, interpréter, analyser et synthétiser des informations et des résultats pertinents, et tirer des conclusions sur des thèmes liés à la biotechnologie.

CG3 - Utiliser des informations en langue étrangère

CG4 - Interpréter des résultats expérimentaux et identifier les éléments cohérents et incohérents.

CG5 - Appliquer les connaissances théoriques et pratiques acquises à la formulation de problèmes et rechercher des solutions de manière efficace et créative, tant dans des contextes professionnels qu'académiques.

CG6 - Étudier et apprendre de manière autonome, en organisant et en planifiant son travail, et acquérir la capacité de travailler en équipe ainsi que la confiance en soi.

COMPÉTENCES SPÉCIFIQUES :

CE2 - Travailler de manière appropriée en laboratoire en appliquant les principes de base de sécurité, de manipulation et d’élimination des déchets, et en tenant un registre détaillé des activités.

CE12 - Identifier les types de biomolécules et établir un lien entre leur structure et la fonction qu’elles remplissent, ainsi que connaître les voies métaboliques et leurs mécanismes de régulation, la cinétique et le mécanisme d’action des enzymes.

Résultats d'apprentissage

Se familiariser avec l’utilisation des principaux équipements et consommables couramment utilisés dans un laboratoire de biochimie

· Identifier les groupes fonctionnels organiques fondamentaux qui caractérisent les différentes biomolécules.

· Interpréter les résultats issus d’études structurales de base sur les protéines et les acides nucléiques.

· Extraire des bases de données structurales les structures des protéines et des acides nucléiques et utiliser les logiciels adaptés à la visualisation et à la compréhension des relations structure-fonction des macromolécules.

· Identifier les motifs et les domaines conservés des protéines.

· Interpréter la relation entre la structure et la fonction des membranes biologiques, identifier les mécanismes de transport et décrire leurs propriétés au niveau moléculaire.

Description du contenu

1. BASES MOLÉCULAIRES

2. GLUCIDES

3. LES LIPIDES

4. NUCLEOTIDES ET ACIDES NUCLEIQUES

5. AMINOACIDES ET PROTÉINES

Activités de formation

Cours magistraux/Séances (SÉANCE dans le calendrier)

Travaux pratiques (LB dans le calendrier)

Séminaires/Travaux (TRAB dans le calendrier)

Tutorats/Consultations/Compléments aux cours magistraux (CN dans le calendrier)

Évaluation

Étude personnelle

Système et critères d'évaluation

Sans préjudice de l'éventuelle définition d'une autre exigence dans le programme de cours correspondant, de manière générale, l'absence à plus de 70 % des activités pédagogiques du cours, nécessitant la présence physique ou virtuelle de l'étudiant, entraînera la perte du droit à l'évaluation continue lors de la session ordinaire. Dans ce cas, l’examen qui se tiendra pendant la période officielle fixée par l’université constituera le seul critère d’évaluation, avec la pondération qui lui est attribuée conformément au programme de la matière.

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RÉSUMÉ DE L'ÉVALUATION PAR PARTIE DU COURS

1. Examens de THÉORIE (SESSION et TRAVAIL) : 60 % de la note.

2. Travaux pratiques de LABORATOIRE (LB) : 30 % de la note.

3. ÉVALUATION CONTINUE (SESSION, TRAVAUX et LABORATOIRE) : 10 % de la note de chaque partie du cours (THÉORIE et LABORATOIRE).

Les contrôles et examens de théorie et de laboratoire, ainsi que la présence aux travaux pratiques de laboratoire, sont OBLIGATOIRES.

Le fait de ne pas passer ces épreuves et examens ou de s'absenter des travaux pratiques entraînera l'échec à la matière.

ÉVALUATION DES CONTENUS THÉORIQUES

1. Au cours de l’année universitaire, deux examens partiels éliminatoires auront lieu.

2. Les dates, horaires et salles d’examen seront communiqués par voie d’avis et sur la plateforme en ligne du cours.

3. Les examens comporteront 20 questions à choix multiple avec 4 options, dont une seule est correcte (les réponses incorrectes entraînent une perte de 33 % de la valeur de la question) et incluront également des questions à développement similaires à celles des exercices TRAB qui se dérouleront sur papier.

4. La note minimale requise pour valider le cours est de 5 sur 10.

5. La note de théorie correspondra à la moyenne des deux examens partiels, à condition que la note de chacun d’entre eux soit d’au moins 3 sur 10.

6. Si la moyenne des examens partiels est inférieure à 5, si l’un des examens partiels a une note inférieure à 3 ou s’il s’agit d’un NP (absent), il faudra repasser le ou les examens partiels échoués lors de la session ordinaire (janvier).

7. Si, après la session ordinaire (janvier), la note reste inférieure à 5, l'étudiant sera convoqué pour repasser le ou les examens partiels non réussis lors de la session extraordinaire (mai/juin).

ÉVALUATION DES CONTENUS PRATIQUES

1. Les travaux pratiques en laboratoire s’étendent sur CINQ SÉANCES. Au cours de 4 séances, l’étudiant recevra un exposé théorique et mettra en pratique différentes techniques de laboratoire ; lors de la 5e séance, les questions seront répondues et un examen portant sur les techniques et les concepts enseignés aura lieu.

2. L’examen se présentera sous forme de questions à choix multiples et/ou de questions courtes. Les questions à choix multiples comporteront 4 options (les réponses incorrectes entraînent une perte de 33 % de la valeur de la question). La note minimale requise pour la réussite est de 5 sur 10.

3. La présence aux travaux pratiques et la participation aux examens de laboratoire SONT OBLIGATOIRES POUR TOUS LES ÉTUDIANTS. Chaque absence non justifiée pendant les travaux pratiques entraîne une perte de 25 % de la note du laboratoire.

4. Le fait de ne pas effectuer les travaux pratiques entraîne l’échec au laboratoire et à la matière.

5. Les étudiants qui, bien qu’ayant assisté aux travaux pratiques, n’ont pas réussi l’examen devront repasser l’examen à choix multiples du laboratoire lors de la session ordinaire.

6. L'échec à la session ordinaire entraîne la répétition de l'examen sous forme de QCM du laboratoire lors de la session extraordinaire.

ÉVALUATION CONTINUE (EC)

En ce qui concerne l’évaluation continue (EC) de la THÉORIE :

Elle consistera en un test en ligne pour chaque thème, comprenant 10 questions à quatre ou cinq choix, dont un seul est correct. Les réponses incorrectes n’entraînent pas de perte de points. Chaque réponse correcte vaut 1 point.

En ce qui concerne l’ÉVALUATION CONTINUE (EC) de LABORATOIRE :

Elle consistera en la réalisation d’un exercice d’auto-évaluation en ligne pour chaque session pratique.

Calendrier

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Bibliographie

De base :

1.- Feduchi Canosa E, Romero Magdalena C, Yáñez Conde E, García-Hoz Jiménez C.

Biochimie. Concepts essentiels.

3e éd. Médica Panamericana. 2025.

ISBN : 9788491106807

Complémentaire :

2.- Lehninger AL, Nelson DL, Cox MM et Cuchillo Foix CM.

Lehninger. Principes de biochimie

7e éd. Omega. 2018.

ISBN : 9788428216678

Autres :

3.- John W. Baynes ; Marek H. Dominiczak

Biochimie médicale

Elsevier. 2024.

ISBN : 978-841382582

4.- Meisenberg, Simmons

Principes de biochimie médicale

4e éd. Elsevier. 2018.

ISBN : 9788491132974

Objectifs

• Savoir identifier les cellules animales et végétales ainsi que leurs organites.

• Comprendre la structure et la fonction des organites cellulaires.

• Identifier la structure et la fonction de la membrane plasmique ainsi que les mécanismes de transport cellulaire.

• Comprendre les relations entre les cellules et leur environnement.

• Connaître les concepts fondamentaux de la structure et de l'organisation de l'ADN, ainsi que ses mécanismes de réplication, de transcription et de traduction.

Compétences

COMPÉTENCES DE BASE / CORE COMPETENCES

CB1 : Les étudiants doivent avoir démontré qu’ils possèdent et comprennent des connaissances dans un domaine d’étude s’appuyant sur les bases de l’enseignement secondaire général, et se situant généralement à un niveau qui, bien que s’appuyant sur des manuels avancés, inclut également certains aspects faisant appel à des connaissances issues de la pointe de leur domaine d’étude. 

CB2 : Les étudiants doivent être capables d’appliquer leurs connaissances à leur travail ou à leur vocation de manière professionnelle et posséder les compétences généralement démontrées par l’élaboration et la défense d’arguments ainsi que par la résolution de problèmes dans leur domaine d’étude. 

CB3 : Que les étudiants soient capables de collecter et d’interpréter des données pertinentes (généralement dans leur domaine d’étude) afin de formuler des jugements incluant une réflexion sur des questions pertinentes d’ordre social, scientifique ou éthique. 

CB4 : Que les étudiants soient capables de transmettre des informations, des idées, des problèmes et des solutions à un public tant spécialisé que non spécialisé. 

CB5 : Que les étudiants aient développé les aptitudes d’apprentissage nécessaires pour entreprendre des études supérieures avec un haut degré d’autonomie.

COMPÉTENCES GÉNÉRALES/GENERAL COMPETENCES

CG1 – Capacité à penser de manière intégrée, à raisonner de façon critique et à aborder les problèmes sous différents angles. /GC1 - Ability  to think in a multi-level way, to develop critical questioning and to tackle problems from different perspectives. 

CG2 – Savoir collecter, traiter, interpréter, analyser et synthétiser des informations et des résultats pertinents, et tirer des conclusions sur des thèmes

liés à la biotechnologie. / Être capable de collecter, traiter, interpréter, analyser et synthétiser des informations et des résultats pertinents,

ainsi que de tirer des conclusions sur des questions liées à la biotechnologie.

CG3 - Être capable d’utiliser des sources d’information internationales, ainsi que de communiquer dans une deuxième langue d’

pertinence internationale. / Capacité à accéder à des sources d’information internationales et à communiquer dans une

langue étrangère pertinente.

CG4 - Interpréter des résultats expérimentaux et identifier les éléments cohérents et incohérents./ Capacité à interpréter

résultats expérimentaux et d’identifier les éléments cohérents et incohérents.

CG5 - Appliquer les connaissances théoriques et pratiques acquises à la formulation de problèmes et rechercher des solutions de manière

efficace et créative, tant dans des contextes professionnels qu’académiques. / Capacité à appliquer les connaissances théoriques et pratiques acquises

connaissances acquises à la résolution de problèmes et à la recherche de solutions efficaces et créatives, tant dans des contextes professionnels qu’académiques.

CG6 - Capacité à assimiler de nouveaux concepts et à apprendre de manière autonome, en organisant et en planifiant son travail, et

acquérir la capacité à travailler en équipe et la confiance en soi. / Capacité à assimiler de nouveaux concepts et à apprendre de manière autonome, à

organiser et planifier son propre travail, ainsi que de travailler en équipe en toute confiance.

COMPÉTENCES SPÉCIFIQUES/SPECIFIC COMPETENCES

CE1 - Connaître et comprendre les concepts fondamentaux des mathématiques, de la physique, de la chimie et de la biologie, ainsi que les principaux

outils utilisés dans ces disciplines pour la recherche et le développement de procédés biotechnologiques. / Apprendre et comprendre

les concepts de base des mathématiques, de la physique, de la chimie et de la biologie, ainsi que les principaux outils de ces disciplines utilisés dans la recherche

et au développement de procédés biotechnologiques.

CE2 - Capacité à travailler correctement en laboratoire en appliquant les principes fondamentaux de sécurité, de manipulation et

élimination des déchets, et en tenant un registre détaillé des activités./ Être capable de travailler correctement en laboratoire, c’est-à-dire

en appliquant les principes fondamentaux de manipulation et d’élimination des déchets, ainsi que de sécurité, et en tenant systématiquement un registre des activités.

CE9 - Connaître la structure et le fonctionnement cellulaires, tant au niveau du métabolisme que de l’expression génique, et décrire les

mécanismes moléculaires du transport et de la transduction des signaux./ Apprendre la structure et le fonctionnement de la cellule, tant au niveau de son métabolisme

que de l’expression génétique ; décrire les mécanismes moléculaires de transport et de transduction des signaux.

Résultats d'apprentissage

• Savoir identifier les cellules animales et végétales ainsi que leurs organites.

• Connaître la structure et la fonction des organites cellulaires.

• Identifier la structure et la fonction de la membrane plasmique ainsi que les mécanismes de transport cellulaire.

• Comprendre les relations entre les cellules et leur environnement.

• Connaître les principes fondamentaux de la structure et de l'organisation de l'ADN, ainsi que ses mécanismes de réplication, de transcription et de traduction.

Description du contenu

PROGRAMME : INTRODUCTION À LA BIOLOGIE CELLULAIRE.

Chapitre 1. La cellule. Cellules procaryotes et eucaryotes.

Chapitre 2. Structure de la membrane.

Chapitre 3. Transport membranaire.

Chapitre 4. Propriétés électriques des membranes.

Chapitre 5. Le cytosquelette. Les filaments intermédiaires.

Chapitre 6. Le cytosquelette. Les microtubules.

Chapitre 7. Le cytosquelette. Les microfilaments.

Chapitre 8. Le noyau.

Chapitre 9. Compartiments intracellulaires et tri des protéines.

Chapitre 10. Le trafic membranaire intracellulaire.

Chapitre 11. Les mitochondries et les chloroplastes.

Activités pédagogiques

Cours magistraux/Séances (SÉANCE dans le calendrier)

Travaux pratiques (LB dans le calendrier)

Séminaires/Travaux (TRAB dans le calendrier)

Tutorats/Consultations/Compléments aux cours magistraux (CN dans le calendrier)

Évaluation (EV dans le calendrier)

Étude personnelle

Système et critères d’évaluation

Sans préjudice de la possibilité d’établir une autre exigence dans le programme du cours correspondant, en règle générale, le fait de ne pas assister à plus de 70 % des activités d’apprentissage du cours nécessitant la présence physique ou virtuelle de l’étudiant entraînera la perte du droit à l’évaluation continue lors de la session d’examens ordinaire. Dans ce cas, l’examen qui se tiendra pendant la période officielle fixée par l’université constituera le seul critère d’évaluation, avec la pondération qui lui est attribuée conformément au programme du cours.

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ÉVALUATION CONTINUE

• Deux tests éliminatoires, l’un à mi-semestre et l’autre à la fin du semestre. Cette partie représente 65 % de la note finale. Une note minimale de 4,5 est requise pour réussir les examens lors de toutes les sessions

• Réalisation des devoirs, attitude et assiduité : 15 % de la note finale.

• Travaux pratiques en laboratoire : 20 % de la note finale.

o Les travaux pratiques se déroulent sur plusieurs jours consécutifs, pour un total de 15 heures. La présence est obligatoire.

o Un contrôle aura lieu à la fin des travaux pratiques. Une note minimale de 4,5 est requise pour réussir ce contrôle.

SESSION ORDINAIRE

• Examen organisé pendant la session ordinaire pour les parties du cours qui n’ont pas été validées par des contrôles, ainsi que pour le contenu des travaux pratiques, dans le cas où l’examen n’aurait pas été réussi pendant la période des travaux pratiques. Cet examen a lieu à la fin du semestre. Une note minimale de 4,5 dans chaque partie est requise pour réussir les examens.

SESSION EXTRAORDINAIRE

• Examen organisé pendant la session extraordinaire pour les parties du cours qui n’ont pas été validées lors des contrôles, ainsi que pour le contenu des travaux pratiques, dans le cas où l’examen n’aurait pas été réussi pendant la période de travaux pratiques. Il a lieu à la fin de l’année universitaire. Une note minimale de 4,5 est requise pour chaque partie afin de réussir les examens.

Calendrier

Cliquez sur ce lien pour obtenir le calendrier détaillé au format Excel

Bibliographie

de base :

1.- Alberts et al.

Molecular Biology of the Cell

6e éd. Garland Science. 2014.

ISBN : 9780815344322

Complémentaire :

2.- Alberts et al.

Introduction à la biologie cellulaire

5e éd. Panamericana. 2021.

ISBN : 9786078546442

Objectifs

Ce cours a pour objectif de fournir les bases mathématiques nécessaires à tout diplômé en biotechnologie, afin qu’il puisse les utiliser comme outil essentiel dans les développements technologiques et les modèles scientifiques liés aux processus biotechnologiques. Elle vise à aider les étudiants à maîtriser les mathématiques qui leur permettront de comprendre d’autres matières dans les domaines de la physique, de la chimie et de la biologie.

Compétences

COMPÉTENCES DE BASE

CB1 : Les étudiants doivent avoir démontré qu’ils possèdent et comprennent des connaissances dans un domaine d’étude s’appuyant sur les bases de l’enseignement secondaire général, et se situant généralement à un niveau qui, bien que s’appuyant sur des manuels avancés, inclut également certains aspects nécessitant des connaissances issues de la pointe de leur domaine d’étude. 

CB2 : Que les étudiants sachent appliquer leurs connaissances à leur travail ou à leur vocation de manière professionnelle et possèdent les compétences qui s’expriment généralement par l’élaboration et la défense d’arguments ainsi que par la résolution de problèmes dans leur domaine d’étude. 

CB3 : Que les étudiants soient capables de collecter et d’interpréter des données pertinentes (généralement dans leur domaine d’étude) afin de formuler des jugements incluant une réflexion sur des questions pertinentes d’ordre social, scientifique ou éthique. 

CB4 : Que les étudiants soient capables de transmettre des informations, des idées, des problèmes et des solutions à un public tant spécialisé que non spécialisé. 

CB5 : Que les étudiants aient développé les aptitudes d’apprentissage nécessaires pour entreprendre des études supérieures avec un haut degré d’autonomie. 

COMPÉTENCES GÉNÉRALES

CG1 – Penser de manière intégrée, raisonner de manière critique et aborder les problèmes sous différents angles.

CG2 – Savoir obtenir, traiter, interpréter, analyser et synthétiser des informations et des résultats pertinents, et tirer des conclusions sur des thèmes liés à la biotechnologie.

CG4 - Interpréter des résultats expérimentaux et identifier les éléments cohérents et incohérents.

CG5 – Appliquer les connaissances théoriques et pratiques acquises à la formulation de problèmes et rechercher des solutions de manière efficace et créative, tant dans des contextes professionnels qu’académiques.

CG6. – Étudier et apprendre de manière autonome, en organisant et en planifiant son travail, et acquérir la capacité de travailler en équipe ainsi que la confiance en soi.

COMPÉTENCES SPÉCIFIQUES

CE1. – Connaître et comprendre les concepts fondamentaux des mathématiques, de la physique, de la chimie et de la biologie, ainsi que les principaux outils utilisés dans ces disciplines pour la recherche et le développement de procédés biotechnologiques.

Résultats d’apprentissage

- Comprendre les mathématiques comme un outil essentiel au développement des connaissances scientifiques et technologiques.

- Formuler et résoudre des problèmes en utilisant le langage des mathématiques.

- Identifier les modèles mathématiques pertinents en biotechnologie.

Description du contenu

1. CALCUL DIFFÉRENTIEL

Révision des fonctions réelles élémentaires. Dérivée d’une fonction réelle à une variable réelle. Règles de dérivation. Dérivées d’ordre supérieur. Polynôme de Taylor. Dérivée d’une fonction réelle à plusieurs variables réelles. Dérivées partielles. Applications du calcul différentiel.

2. CALCUL INTÉGRAL

Notion d’intégrale indéfinie et ses propriétés. Calcul des primitives d’une fonction réelle à variable réelle : méthodes d’intégration. L’intégrale définie : théorème fondamental du calcul. Règle de Barrow. Notion d’intégrale multiple. Intégration de fonctions à plusieurs variables. Applications du calcul intégral.

3. ÉQUATIONS DIFFÉRENTIELLES

Notion d’équation différentielle et de sa solution. Équations différentielles ordinaires. Intégration des équations différentielles. Applications des équations différentielles ordinaires.

4. ALGÈBRE LINÉAIRE

Types de matrices et opérations sur les matrices. Calcul des déterminants des matrices carrées. Rang et inverse d’une matrice. Systèmes d’équations linéaires et leur expression matricielle. Théorème de Rouché-Frobenius. Règle de Cramer. Méthode de Gauss pour la résolution de systèmes d'équations. Applications de l'algèbre linéaire.

Activités pédagogiques

Cours magistral/Séances (SÉANCE dans le calendrier)

Travaux pratiques (LB dans le calendrier)

Séminaires/Travaux (TRAB dans le calendrier)

Tutorats/Consultations/Compléments aux cours magistraux (CN dans le calendrier)

Évaluation (EV dans le calendrier)

Étude personnelle

Système et critères d'évaluation

Sans préjudice de l'éventuelle définition d'une autre exigence dans le programme de cours correspondant, de manière générale, l'absence à plus de 70 % des activités pédagogiques du cours, nécessitant la présence physique ou virtuelle de l'étudiant, entraînera la perte du droit à l'évaluation continue lors de la session ordinaire. Dans ce cas, l’examen qui se tiendra pendant la période officielle fixée par l’université constituera le seul critère d’évaluation, avec la pondération qui lui correspond selon le programme de la matière.

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Le processus d’évaluation consistera à vérifier et à évaluer l’acquisition des compétences par l’étudiant. À cette fin, les activités d’évaluation suivantes seront utilisées afin de déterminer le degré d’assimilation de chacune des compétences énumérées ; elles consisteront en :

- Des épreuves d'évaluation finales en présentiel, consistant en des examens écrits portant sur les contenus abordés dans les activités de formation.

- Des épreuves d'évaluation en présentiel destinées à mettre en pratique les concepts étudiés dans le cours, consistant en la résolution de problèmes, l'élaboration et la présentation de projets sur des cas pratiques.

- Des activités que l’étudiant envoie via la plateforme d’apprentissage en ligne (devoirs, exercices proposés), ainsi que des exposés en classe.

Les résultats obtenus par l’étudiant dans le cadre de ce cours seront notés selon l’échelle numérique suivante, de 0 à 10, avec une décimale, à laquelle pourra s’ajouter la mention qualitative correspondante :

a. 0-4,9 : Échec (SS).

b. 5,0-6,9 : Admis (AP).

c. 7,0-8,9 : Bien (NT).

d. 9,0-10 : Très bien (SB).

La mention « Mention très bien » sera attribuée aux étudiants ayant obtenu une note égale ou supérieure à 9,0. Leur nombre ne pourra pas dépasser cinq pour cent des étudiants inscrits à la matière au cours de l’année universitaire correspondante, sauf si le nombre d’étudiants inscrits est inférieur à 20, auquel cas une seule « mention d’honneur » pourra être attribuée.

Le cours est structuré en deux parties : la partie 1, consacrée au calcul différentiel et au calcul intégral ; la partie 2, consacrée aux équations différentielles et à l’algèbre linéaire. Au cours du semestre, deux examens partiels auront lieu, un pour chaque partie, au cours desquels les compétences seront évaluées de manière à refléter les activités pédagogiques réalisées. De plus, une série de travaux et d’activités portant sur les deux parties sera proposée, à réaliser aussi bien en classe qu’en dehors.

Les critères d’évaluation continue sont détaillés ci-dessous :

• L'examen partiel 1 est le premier examen partiel du cours. (34 %). Il porte sur la partie 1 consacrée au calcul différentiel et au calcul intégral.

• Examen partiel n° 2 : il s’agit du deuxième examen partiel du cours. (34 %). Il porte sur la partie 2, consacrée aux équations différentielles et à l’algèbre linéaire.

• Remise des devoirs en ligne (15 %). Portant sur la partie 1 et la partie 2.

• Remise et présentation des travaux pratiques (17 %). Portant sur la partie 1 et la partie 2.

La note finale de l’évaluation continue est calculée à partir de la note des deux examens partiels du cours, qui représente 68 % (34 % pour chacun des deux examens), et de la note des autres activités, qui représente 32 % (15 % pour les devoirs en ligne et 17 % pour les travaux pratiques).

Les étudiants pourront ÊTRE ADMIS PAR ÉVALUATION CONTINUE s’ils obtiennent une note égale ou supérieure à 5 points sur 10 après application des pourcentages indiqués, c’est-à-dire en tenant compte des pondérations des différentes épreuves mentionnées ci-dessus. Toutefois, cela est valable à condition d’avoir obtenu une note minimale de 4 points aux deux examens partiels ; dans le cas contraire, il n’est pas possible d’être admis par évaluation continue. La note finale du cours par évaluation continue sera publiée avant la date officielle de l’examen de la session ordinaire.

Les étudiants qui ne réussissent pas le cours dans le cadre de l'évaluation continue pourront se présenter à l'examen de la session ordinaire.

SESSION ORDINAIRE DE FÉVRIER :

Il s'agit d'un examen visant à évaluer les compétences acquises au cours des activités pédagogiques réalisées. Il se compose de deux parties, correspondant chacune à l'un des deux examens partiels : la partie 1 correspondant au premier examen partiel, et la partie 2 correspondant au deuxième examen partiel. Ces deux parties seront notées séparément.

L'étudiant pourra choisir de se présenter à l'intégralité de l'examen ou uniquement à l'une des deux parties s'il souhaite conserver la note obtenue à l'autre partie (dans ce cas, il ne sera évalué que sur l'examen partiel 1 ou sur l'examen partiel 2). Seuls les étudiants ayant obtenu une note égale ou supérieure à 4,0 à l’examen partiel n° 1 ou à l’examen partiel n° 2 pourront être dispensés de cette partie et ne pas y être évalués lors de la session ordinaire. Pour valider le cours, la moyenne générale devra être égale ou supérieure à 5,0.

Si l’étudiant choisit de passer l’examen portant sur l’ensemble de la matière, pour valider la matière, la note totale de l’examen devra être égale ou supérieure à 5,0 et la note inscrite au relevé de notes sera celle obtenue à cet examen, les notes de l’évaluation continue n’étant pas prises en compte.

En aucun cas, une partie de la matière ne sera dispensée ni reportée de la session ordinaire à la session extraordinaire. Par conséquent, les étudiants qui n’auront pas validé la matière lors de la session ordinaire devront la valider dans son intégralité et pourront se présenter à la session extraordinaire.

SESSION EXTRAORDINAIRE DE JUILLET :

Un examen unique portant sur l’ensemble du programme de la matière sera organisé, sans deux parties distinctes, au cours duquel les compétences seront évaluées de manière à refléter les activités pédagogiques réalisées. La note finale correspondra à celle obtenue à cet examen (pondération de 100 %) ; c'est cette note qui figurera dans les relevés de notes. Pour valider la matière, la note obtenue à l'examen de la session extraordinaire devra être égale ou supérieure à 5,0.

Calendrier

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Bibliographie

De base :

1.- Guervos Sánchez, Esther

Fondements des mathématiques : notions théoriques et problèmes r

Bellisco. 2005.

ISBN : 8496486141

2.- Guervós Sánchez, Esther

Introduction au calcul

García-Maroto Editores. 2008.

ISBN : 9788493629984

Complémentaire :

3.- Guevós, E ; García, M.B. ; González, A.

Mathématiques appliquées

García-Moroto Editores. 2008.

ISBN : 9788493629991

4.- Nakos, George

Algèbre linéaire et ses applications

Madrid : Thomson, 1999. 1999.

ISBN : 9687529865

5.- Pedro de Mingo

Calcul

Madrid : Bellisco. 2006.

ISBN : 8448117700

Objectifs

La biotechnologie repose sur la production de composés chimiques par le biais de procédés technologiques faisant appel à des organismes vivants. Elle nécessite la maîtrise de connaissances fondamentales en biologie et en chimie permettant aux étudiants de comprendre ces procédés.

L'objectif principal de ce cours est de familiariser l'étudiant avec le monde de la chimie en vue de son application dans l'exercice de sa profession. Pour cela, l'étudiant apprendra à :

Comprendre et assimiler les principes fondamentaux de la chimie.

Être capable d’appliquer ces connaissances à la résolution de problèmes pratiques.

Développer des compétences expérimentales pour le travail en laboratoire.

Travailler en équipe et parvenir à un résultat commun en mettant en pratique les concepts théoriques appris.

Compétences

COMPÉTENCES DE BASE

CB1 : Les étudiants doivent avoir démontré qu’ils possèdent et comprennent des connaissances dans un domaine d’étude qui s’appuie sur les bases de l’enseignement secondaire général et se situe généralement à un niveau qui, bien qu’il s’appuie sur des manuels avancés, inclut également certains aspects nécessitant des connaissances issues de la pointe de leur domaine d’étude.

CB2 : Que les étudiants sachent appliquer leurs connaissances à leur travail ou à leur vocation de manière professionnelle et possèdent les compétences qui s’expriment généralement par l’élaboration et la défense d’arguments ainsi que par la résolution de problèmes dans leur domaine d’étude.

CB3 : Que les étudiants soient capables de collecter et d’interpréter des données pertinentes (généralement dans leur domaine d’étude) afin de formuler des jugements incluant une réflexion sur des questions pertinentes d’ordre social, scientifique ou éthique.

CB4 : Que les étudiants soient capables de transmettre des informations, des idées, des problèmes et des solutions à un public tant spécialisé que non spécialisé.

CB5 : Que les étudiants aient développé les aptitudes d’apprentissage nécessaires pour entreprendre des études supérieures avec un haut degré d’autonomie.

COMPÉTENCES GÉNÉRALES

CG1 – Penser de manière intégrée, raisonner de manière critique et aborder les problèmes sous différents angles.

CG2 – Savoir obtenir, traiter, interpréter, analyser et synthétiser des informations et des résultats pertinents, et tirer des conclusions sur des thèmes liés à la biotechnologie.

CG4 - Interpréter des résultats expérimentaux et identifier les éléments cohérents et incohérents.

CG5 – Appliquer les connaissances théoriques et pratiques acquises à la formulation de problèmes et rechercher des solutions de manière efficace et créative, tant dans des contextes professionnels qu’académiques.

CG6. – Étudier et apprendre de manière autonome, en organisant et en planifiant son travail, et acquérir la capacité de travailler en équipe ainsi que la confiance en soi.

COMPÉTENCES SPÉCIFIQUES

CE1. – Connaître et comprendre les concepts fondamentaux des mathématiques, de la physique, de la chimie et de la biologie, ainsi que les principaux outils utilisés dans ces disciplines pour la recherche et le développement de procédés biotechnologiques.

CE2. – Travailler de manière appropriée en laboratoire en appliquant les principes fondamentaux de sécurité, de manipulation et d’élimination des déchets, et en tenant un registre détaillé des activités.

Résultats d'apprentissage

- Comprendre la composition de la matière et ses transformations physiques et chimiques.

- Reconnaître les types de liaisons dans un composé chimique et la réactivité qui en découle.

- Maîtriser avec précision la nomenclature et la représentation chimiques, ainsi que le concept de mole et la stœchiométrie dans les processus chimiques.

- Comprendre les concepts fondamentaux relatifs aux solutions et aux équilibres chimiques.

- Décrire et analyser les principes chimiques appliqués en biotechnologie.

-Faire preuve d’aptitudes et d’habileté en laboratoire expérimental, notamment dans l’utilisation du matériel scientifique.

- Savoir manipuler les produits chimiques et évaluer les risques liés à leur utilisation en laboratoire.

- Rédiger des rapports sur les travaux pratiques réalisés dans les différents laboratoires.

-Appliquer les connaissances théoriques à la pratique : résolution de problèmes.

Description des contenus

Thème 1.- La composition de la matière.

1.1 Classification de la matière : substances pures et mélanges. Méthodes de

séparation. Propriétés extensives et intensives.

1.2 Éléments chimiques. Numéro atomique. Numéro de masse.

Masse atomique.

1.3 Composés chimiques. Atomes, molécules et ions.

1.4 Tableau périodique. Propriétés périodiques des éléments : rayon atomique

ionique, énergie d’ionisation, affinité électronique, électronégativité.

1.5 Moles et masse molaire. Formule empirique et moléculaire.

Thème 2. – Nomenclature en chimie inorganique.

Thème 3. – Liaison chimique

3.1 Liaison ionique.

3.2 Liaison covalente. Structures de Lewis. Moment dipolaire. Géométrie

. Théorie des orbitales. Orbitales moléculaires. Hybridation.

3.3 Liaison métallique.

Thème 4.- État liquide et état solide. Changements d'état.

4.1 Forces intermoléculaires.

4.2 Solides amorphes et cristallins. Types de cristaux.

4.3 Équilibre liquide-vapeur

4.3.1 Pression de vapeur. Point d'ébullition.

4.3.2 Liquéfaction des gaz. Point critique

4.4 Équilibre solide-liquide : point de fusion

4.5 Équilibre solide-vapeur : sublimation.

4.6 Diagrammes de phase. Point triple.

Thème 5. – Les solutions.

5.1 Types de solutions. Mesures de concentration.

5.2 Stœchiométrie des réactions chimiques en solution.

5.3 Saturation et solubilité.

5.4 Facteurs influençant la solubilité :

5.5 Propriétés colligatives des solutions. Solutions idéales. Facteur de

van’t Hoff.

Thème 6. – La réaction chimique. Stœchiométrie.

6.1 Équations chimiques.

6.2 Types de réactions chimiques :

6.2.1 Réactions acide-base.

6.2.2 Réactions de précipitation.

6.2.3 Réactions d'oxydoréduction. Équilibrage des réactions d'oxydoréduction.

6.3 Calculs stœchiométriques à partir d’équations chimiques.

6.4 Réactif limitant. Rendement de la réaction.

Thème 7. – Équilibre chimique.

7.1 Réactions à l'équilibre.

7.2 Constante d'équilibre. Équilibre homogène. Équilibre hétérogène.

7.3 Calculs d'équilibre.

7.4 Facteurs influençant l'équilibre chimique. Principe de Le Chatelier.

7.5 Énergie libre et équilibre chimique.

Thème 8. – Équilibres acide-base.

8.1 Définitions de l'acide et de la base.

8.2 Constante d’ionisation. Force des acides et des bases.

8.3 Auto-ionisation de l’eau. Échelle de pH.

8.4 Calcul du pH des solutions d’acides et de bases. Acides polyprotiques.

8.5 Calcul du pH des solutions de sels. Ions acides et basiques.

8.6 Solutions mixtes : effet de l’ion commun. Tampons.

Thème 9. – Électrochimie.

9.1 Piles électrochimiques. Types de piles.

9.2 Potentiel d’une pile. Potentiel standard d’une électrode. Spontanéité des

réactions redox.

9.3 Dépendance du potentiel de pile par rapport à la concentration. Équation de

Nernst. Piles de concentration.

9.4 Piles électrolytiques. Loi de Faraday

Activités pédagogiques

Cours magistral/Séances (SÉANCE dans le calendrier)

Travaux pratiques (LB dans le calendrier)

Séminaires/Travaux (TRAB dans le calendrier)

Tutorats/Consultations/Compléments aux cours magistraux (CN dans le calendrier)

Évaluation (EV dans le calendrier)

Étude personnelle

Système et critères d'évaluation

Sans préjudice de l'éventuelle définition d'une autre exigence dans le programme de cours correspondant, de manière générale, l'absence à plus de 70 % des activités pédagogiques du cours, nécessitant la présence physique ou virtuelle de l'étudiant, entraînera la perte du droit à l'évaluation continue lors de la session ordinaire. Dans ce cas, l’examen qui se tiendra pendant la période officielle fixée par l’université constituera le seul critère d’évaluation, avec la pondération qui lui correspond selon le programme de la matière.

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Pour valider ce cours, il est nécessaire :

1. Avoir effectué TOUS les travaux pratiques de laboratoire.

2. Obtenir une note égale ou supérieure à cinq points en additionnant les pourcentages indiqués ci-dessous :

ÉVALUATION CONTINUE :

- Épreuve de formulation et de nomenclature inorganique (10 % de la note finale). IL EST NÉCESSAIRE DE LA RÉUSSIR AVEC UNE NOTE SUPÉRIEURE OU ÉGALE À 5.

- Épreuve partielle n° 1 : thèmes 1 et 3 à 5 (25 % de la note finale)

- Épreuve partielle n° 2 : thèmes 6 à 9 (25 % de la note finale)

Ces trois évaluations seront validantes si la note obtenue est égale ou supérieure à 5.

Les deux examens partiels peuvent être compensés si une note égale ou supérieure à 4 est obtenue. En cas d’échec ou de non-compensation, l’étudiant devra se présenter à la session ordinaire et/ou extraordinaire pour les parties non validées.

- Travaux pratiques en laboratoire : 20 % + 5 %. LA PARTICIPATION AUX TRAVAUX PRATIQUES EST OBLIGATOIRE

* L'évaluation des travaux pratiques se fera au moyen d'un examen final (20 %). Note minimale pour être prise en compte dans la moyenne : 4.

* 5 % : Réalisation des rapports et des exercices de laboratoire.

- Travail de l'étudiant : 15 %

* 5 % : Test sur la plateforme Jove

* 10 % : activités en classe (remise d'exercices, intervention au tableau...)​

POUR QUE LES CRITÈRES D'ÉVALUATION CONTINUE SOIENT APPLIQUÉS, L'ÉTUDIANT DOIT OBTENIR UNE NOTE MINIMALE DE 5 POINTS À LA MOYENNE DES DEUX ÉPREUVES PARTIELLES.

La note finale maximale sera de 10 points. Pour valider le cours, la note finale devra être égale ou supérieure à 5 points.

SESSION ORDINAIRE :

Si l’étudiant ne remplit pas les conditions requises pour l’application des critères d’évaluation continue, il devra se présenter à la session ordinaire pour les parties non validées, qu’il s’agisse de la formulation, d’un ou plusieurs examens partiels et/ou d’une partie des travaux pratiques non validée, en appliquant les pourcentages décrits ci-dessus pour calculer sa note finale. Pour valider la matière, l’étudiant devra obtenir une note finale de 5 points sur 10.

SESSION EXTRAORDINAIRE :

En cas d’échec à la session ordinaire, l’étudiant devra se présenter à la session extraordinaire pour les parties non validées, qu’il s’agisse de la formulation, d’un examen partiel ou de plusieurs examens partiels et/ou d’une partie des travaux pratiques non validée, en appliquant les pourcentages décrits ci-dessus pour calculer sa note finale. Pour réussir, l’étudiant devra obtenir une note finale de 5 sur 10.

Caractéristiques des examens :

- Examens partiels : ils comprendront une série de questions théoriques courtes (type QCM) et une série de problèmes.

- Examen pratique : l’évaluation des travaux pratiques se fera par la réalisation d’une dissolution tampon en groupes au laboratoire et par la passation d’un examen individuel le DERNIER JOUR des travaux pratiques. Cet examen consistera en un questionnaire à choix multiples et en des problèmes correspondant aux travaux pratiques effectués.

La présence aux travaux pratiques est obligatoire. Il n’est pas autorisé de s’absenter d’un travail pratique, sauf pour un motif très justifié.

Calendrier

Cliquez sur ce lien pour obtenir le calendrier détaillé au format Excel

Bibliographie

De base :

1.- Atkins, Jones

Principes de chimie

Panamericana. 2012.

ISBN : 9789500602822

2.- Chang, Goldsby

Chimie

McGraw-Hill Interamericana de España S.L. 2017.

ISBN : 9786071513939

3.- J. M. TEIJÓN, J. A. GARCÍA, Y. JIMÉNEZ et Y. GUERRERO

La chimie à travers des problèmes

Tebar. 2006.

ISBN : 9788473602266

4.- López Cancio, José Antonio

Problèmes de chimie

Madrid [etc.] : Prentice-Hall, 2000. 2000.

ISBN : 9788420529950

5.- Mahan, Bruce M.

Chimie : cours universitaire

Argentine [etc.] : Addison Wesley, 1990. 1990.

ISBN : 0201644193

6.- Petrucci, R.

Chimie générale

Pearson. 2017.

ISBN : 9788490355336

Objectifs

L'étudiant apprendra les principales techniques de statistique descriptive, à modéliser l'incertitude associée aux phénomènes aléatoires à l'aide de modèles probabilistes, ainsi qu'à estimer et à tester des hypothèses sur les paramètres d'une ou plusieurs populations.

Compétences

COMPÉTENCES DE BASE

CB1 : Les étudiants doivent avoir démontré qu’ils possèdent et comprennent des connaissances dans un domaine d’étude qui s’appuie sur les bases de l’enseignement secondaire général et se situe généralement à un niveau qui, bien qu’il s’appuie sur des manuels avancés, inclut également certains aspects nécessitant des connaissances issues de la pointe de leur domaine d’étude. 

CB2 : Les étudiants doivent savoir appliquer leurs connaissances à leur travail ou à leur vocation de manière professionnelle et posséder les compétences qui s’expriment généralement par l’élaboration et la défense d’arguments ainsi que par la résolution de problèmes dans leur domaine d’étude. 

CB3 : Que les étudiants soient capables de collecter et d’interpréter des données pertinentes (généralement dans leur domaine d’étude) afin de formuler des jugements incluant une réflexion sur des questions pertinentes d’ordre social, scientifique ou éthique. 

CB4 : Que les étudiants soient capables de transmettre des informations, des idées, des problèmes et des solutions à un public tant spécialisé que non spécialisé. 

CB5 : Que les étudiants aient développé les aptitudes d’apprentissage nécessaires pour entreprendre des études supérieures avec un haut degré d’autonomie. 

COMPÉTENCES GÉNÉRALES

CG1 – Penser de manière intégrée, raisonner de manière critique et aborder les problèmes sous différents angles.

CG2 – Savoir obtenir, traiter, interpréter, analyser et synthétiser des informations et des résultats pertinents, et tirer des conclusions sur des thèmes liés à la biotechnologie.

CG4 - Interpréter des résultats expérimentaux et identifier les éléments cohérents et incohérents.

CG5. – Appliquer les connaissances théoriques et pratiques acquises à la formulation de problèmes et rechercher des solutions de manière efficace et créative, tant dans des contextes professionnels qu’académiques.

CG6. – Étudier et apprendre de manière autonome, en organisant et en planifiant son travail, et acquérir la capacité de travailler en équipe ainsi que la confiance en soi.

COMPÉTENCES SPÉCIFIQUES

CE1. – Connaître et comprendre les concepts fondamentaux des mathématiques, de la physique, de la chimie et de la biologie, ainsi que les principaux outils utilisés dans ces disciplines pour la recherche et le développement de procédés biotechnologiques.

CE6. – Savoir utiliser les méthodes mathématiques, statistiques et informatiques essentielles à l’étude, à l’interprétation et au contrôle d’expériences ou de procédés biotechnologiques.

Résultats d'apprentissage

Interpréter les niveaux de précision, de confiance et d’erreur dans les conclusions d’une étude statistique.

Maîtriser un logiciel de statistiques au niveau utilisateur.

Analyser des données de manière descriptive.

Calculer des intervalles de confiance pour les moyennes et les proportions, en déterminant la taille appropriée de l'échantillon.

Comprendre le lien entre les intervalles de confiance et le test d'hypothèse.

Interpréter la valeur P et en tirer des conclusions.

Distinguer les échantillons indépendants des échantillons appariés.

Distinguer les méthodes paramétriques des méthodes non paramétriques.

Comparer une ou deux moyennes ou proportions en fonction du type et du nombre de données.

Connaître les concepts de facteur de risque, de risque relatif et d’odds ratio

Description des contenus

• T1 : Statistiques descriptives. Types d'expériences, types de variables, organisation et codage des données, synthèse des variables qualitatives (fréquences, rapport de cotes, risque relatif) et quantitatives (mesures de tendance centrale, quantiles, dispersion et asymétrie), graphiques des variables qualitatives et quantitatives.

• T2 : Probabilité. Événements, théorie des ensembles, définitions de la probabilité, diagramme de Venn, probabilité conditionnelle, indépendance des événements, théorème de la probabilité totale, théorème de Bayes.

• T3 : Distributions de probabilité. Variables aléatoires, distributions binomiale, de Poisson, uniforme et normale, typification, approximations entre distributions.

• T4 : Inférence statistique (I). Sources d’erreur, distribution d’échantillon, théorème de la limite centrale, erreur-type, estimation ponctuelle et intervalles de confiance pour les moyennes et les proportions.

• T5 : Inférence statistique (II). Test d’hypothèses, types d’erreurs, puissance, niveau de signification, valeur p, test unilatéral et bilatéral, tests statistiques de comparaison des moyennes et des proportions, z (distribution normale standard), t de Student, Fisher-Snedecor, chi carré, intervalle de confiance pour la différence de moyennes et de proportions, corrélation, tests paramétriques et non paramétriques

Activités de formation

Cours magistral/Séances (SÉANCE dans le calendrier)

Travaux pratiques (LB dans le calendrier)

Séminaires/Travaux (TRAB dans le calendrier)

Tutorats/Consultations/Compléments aux cours magistraux (CN dans le calendrier)

Évaluation (EV dans le calendrier)

Étude personnelle

Système et critères d'évaluation

Sans préjudice de l'éventuelle définition d'une autre exigence dans le programme de cours correspondant, de manière générale, l'absence à plus de 70 % des activités pédagogiques du cours, nécessitant la présence physique ou virtuelle de l'étudiant, entraînera la perte du droit à l'évaluation continue lors de la session ordinaire. Dans ce cas, l’examen qui se tiendra pendant la période officielle fixée par l’université constituera le seul critère d’évaluation, avec la pondération qui lui correspond selon le programme de la matière.

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- Évaluation des contenus abordés lors des cours et dans les travaux : elle représente 60 % de la note finale de la matière. Deux examens auront lieu au cours du semestre ; il s’agira d’examens « pseudo-libératoires » pour lesquels une note égale ou supérieure à 5 est requise (il n’est pas possible de résoudre les exercices de la deuxième partie sans savoir résoudre ceux de la première). Le premier examen comptera pour 15 % de la note finale et le second pour 45 %. Si vous obtenez une note inférieure à 5, vous devrez vous présenter à l’examen de la session ordinaire et/ou extraordinaire.

- Épreuve d'évaluation des travaux pratiques : destinée à mettre en pratique les concepts étudiés dans chaque cours. L'évaluation de ces connaissances se déroule en présentiel. Elle représente 25 % de la note finale du cours.

- Présentation orale en binôme visant à expliquer la partie mathématique de la conception et de l'analyse d'une expérience hypothétique (15 %).

Calendrier

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Bibliographie

De base :

1.- Geoffrey R. Norman

Biostatistics: the bare essentials

PMPH-USA Limited. 2014.

ISBN : 1607951789

2.- Marc Triola

La biostatistique pour les sciences de la vie et de la santé

Financial Times Prentice Hall. 2017.

ISBN : 9780134039015

Objectifs

- Apprendre les concepts fondamentaux relatifs à la nature, à l'organisation, au rôle et à la transmission du matériel héréditaire. Apprendre les principes de l'hérédité mendélienne et leurs implications.

- Acquérir des connaissances sur la structure du matériel génétique, sa transmission et son expression chez différents organismes.

- Identifier les sources de variation génétique et les différents types de mutations, ainsi que connaître les techniques d’analyse et de manipulation génétiques.

- Acquérir des connaissances sur les aspects généraux des génomes.

- Maîtriser la terminologie scientifique de base de la matière.

- Connaître les sources bibliographiques liées à la matière et savoir comment y accéder.

- Acquérir des compétences et des aptitudes en génétique en vue de l’exercice futur de la profession.

Compétences

COMPÉTENCES DE BASE

CB1 : Les étudiants doivent avoir démontré qu’ils possèdent et comprennent des connaissances dans un domaine d’étude qui s’appuie sur les bases de l’enseignement secondaire général et se situe généralement à un niveau qui, bien qu’il s’appuie sur des manuels avancés, inclut également certains aspects nécessitant des connaissances issues de la pointe de leur domaine d’étude.

CB2 : Que les étudiants sachent appliquer leurs connaissances à leur travail ou à leur vocation de manière professionnelle et possèdent les compétences qui s’expriment généralement par l’élaboration et la défense d’arguments ainsi que par la résolution de problèmes dans leur domaine d’étude.

CB3 : Que les étudiants soient capables de collecter et d’interpréter des données pertinentes (généralement dans leur domaine d’étude) afin de formuler des jugements incluant une réflexion sur des questions pertinentes d’ordre social, scientifique ou éthique.

CB4 : Que les étudiants soient capables de transmettre des informations, des idées, des problèmes et des solutions à un public tant spécialisé que non spécialisé.

CB5 : Que les étudiants aient développé les aptitudes d’apprentissage nécessaires pour entreprendre des études supérieures avec un haut degré d’autonomie.

COMPÉTENCES GÉNÉRALES

CG1 – Penser de manière intégrée, raisonner de manière critique et aborder les problèmes sous différents angles.

CG2 – Savoir obtenir, traiter, interpréter, analyser et synthétiser des informations et des résultats pertinents, et tirer des conclusions sur des thèmes liés à la biotechnologie.

CG3 - Être capable d’utiliser des sources d’information internationales, ainsi que de communiquer dans une deuxième langue d’importance internationale.

CG4 - Interpréter des résultats expérimentaux et identifier les éléments cohérents et incohérents.

CG5 – Appliquer les connaissances théoriques et pratiques acquises à la formulation de problèmes et rechercher des solutions de manière efficace et créative, tant dans des contextes professionnels qu’académiques.

CG6. - Étudier et apprendre de manière autonome, en organisant et en planifiant son travail, et acquérir la capacité de travailler en équipe ainsi que la confiance en soi.

COMPÉTENCES SPÉCIFIQUES

CE2. – Travailler de manière appropriée en laboratoire en appliquant les principes de base en matière de sécurité, de manipulation et d’élimination des déchets, et en tenant un registre détaillé des activités.

CE11. – Connaître la structure, l’organisation et la régulation de l’expression des gènes, ainsi que les bases moléculaires de la variation génétique et épigénétique.

Résultats d’apprentissage

• Connaître l’importance et l’utilisation des mutants dans l’analyse génétique.

• Calculer les différents types de gamètes possibles – ainsi que leurs fréquences – à partir d’un génotype.

• Distinguer et analyser les différents types de ségrégations mendéliennes en fonction des relations alléliques et/ou géniques impliquées.

• Appliquer correctement le test d’allélisme et le concept de complémentation génétique.

• Comprendre la structure et le fonctionnement du chromosome eucaryote.

• Établir des cartes génétiques

• Reconnaître les différents types de mutations chromosomiques et leur effet sur le phénotype.

• Connaître les implications génétiques du modèle de la double hélice de l’ADN.

• Connaître les bases moléculaires de la mutation et de la réparation de l’ADN.

• Comprendre le fonctionnement et la transmission des gènes additifs.

Description du contenu

TRANSMISSION DU MATÉRIEL HÉRÉDITAIRE

THÈME 1 : GÉNÉTIQUE MENDÉLIENNE. Les expériences de Mendel. Phénotype et génotype. Hérédité mendélienne chez l’espèce humaine.

THÈME 2 : EXTENSIONS DE L'ANALYSE GÉNÉTIQUE MENDÉLIENNE. Allèles multiples. Modifications du rapport de dominance. Interactions géniques. Pénétrance et expressivité.

THÈME 3 : BASES CHROMOSOMIQUES DE L'HÉRÉDITÉ. La théorie chromosomique de l'hérédité. Chromosomes procaryotes et eucaryotes. Division cellulaire : mitose et méiose. Liaison et recombinaison. Cartes génétiques.

THÈME 4. MODES DE TRANSMISSION. Arbres généalogiques. Base génétique des pathologies humaines.

STRUCTURE DU MATÉRIEL HÉDITAIRE

THÈME 5. LE MATÉRIEL GÉNÉTIQUE. L’ADN en tant que matériel héréditaire. L’ARN en tant que matériel héréditaire. Composition et structure des acides nucléiques. Structure de l’ADN. Structure des chromosomes.

THÈME 6. RÉPLICATION DU MATÉRIEL HÉDITAIRE. Caractéristiques générales chez les procaryotes et les eucaryotes.

EXPRESSION ET VARIATION DU MATÉRIEL GÉNÉTIQUE

THÈME 7. EXPRESSION DE L'INFORMATION GÉNÉTIQUE. La relation gène-enzyme. Transcription. Traitement. Traduction. Code génétique.

THÈME 8. RÉGULATION DE L'ACTIVITÉ GÉNÉTIQUE CHEZ LES EUCARYOTES. Régulation transcriptionnelle et post-transcriptionnelle. Épigénétique. Micro-ARN.

THÈME 9. MUTATION ET VARIATION GÉNÉTIQUE. Base moléculaire. Mutations géniques. Réparation. Mutagenèse. Transposition. Mutation et adaptation.

THÈME 10. MUTATIONS CHROMOSOMIQUES STRUCTURELLES ET NUMÉRIQUES. Types. Origines. Conséquences génétiques.

THÈME 11. IDENTIFICATION DE LA BASE GÉNÉTIQUE DES MALADIES. Analyse de liaison. Analyse d’association. Séquençage direct du génome.

THÈME 12. GÉNÉTIQUE DU CANCER. Oncogènes et gènes suppresseurs. Instabilité

GÉNIE GÉNÉTIQUE ET GÉNOMIQUE

THÈME 13. ANALYSE ET MANIPULATION GÉNÉTIQUES. Technologie de l’ADN recombinant. Réaction en chaîne par polymérase (PCR). Hybridation. Séquençage. Transgénèse. Édition génétique.

THÈME 14. GÉNOMIQUE STRUCTURELLE, FONCTIONNELLE ET COMPARÉE. Composition du génome. Bases de données génomiques. Transcriptomique.

Activités pédagogiques

Cours magistraux/Séances (SÉANCE dans le calendrier)

Travaux pratiques (LB dans le calendrier)

Séminaires/Travaux (TRAB dans le calendrier)

Tutorats/Consultations/Compléments aux cours magistraux (CN dans le calendrier)

Évaluation (EV dans le calendrier)

Étude personnelle

Système et critères d'évaluation

Sans préjudice de l'éventuelle définition d'une autre exigence dans le programme de cours correspondant, de manière générale, l'absence à plus de 70 % des activités pédagogiques du cours, nécessitant la présence physique ou virtuelle de l'étudiant, entraînera la perte du droit à l'évaluation continue lors de la session ordinaire. Dans ce cas, l’examen qui se tiendra pendant la période officielle fixée par l’université constituera le seul critère d’évaluation, avec la pondération qui lui correspond selon le programme de la matière.

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Épreuve d'évaluation finale en présentiel

Participation aux forums et autres supports participatifs : elle est évaluée en tenant compte de l’utilisation et de la participation de l’étudiant aux sessions en présentiel ou en ligne, aux ateliers, aux forums, etc.

Épreuve d’évaluation des travaux pratiques : destinée à mettre en pratique les concepts étudiés dans chaque cours. L’évaluation de ces connaissances a lieu à la fin du cours, en présentiel.

Travaux : ce critère prend en compte les activités que l’étudiant envoie via la plateforme d’apprentissage en ligne (devoirs, projets, études de cas) ainsi que les exposés en classe.

L’évaluation des étudiants se fera en tenant compte, outre les examens, des travaux pratiques et de la remise de travaux tout au long du semestre, selon les critères suivants :

1. Avoir effectué les travaux pratiques en laboratoire.

2. Obtenir une note égale ou supérieure à cinq points en additionnant les pourcentages indiqués ci-dessous :

a) Théorie. Elle représente 70 % de la note finale.

- Épreuve partielle 1 : thèmes 1 à 6.

- Épreuve partielle n° 2 : thèmes 7 à 13.

Ces examens pourront être pris en compte dans la moyenne à condition d'obtenir au moins un 4 et que la moyenne des deux examens partiels soit égale ou supérieure à 5.

En cas d’échec ou si les examens partiels ne permettent pas de compenser, l’étudiant devra se présenter à la session ordinaire et/ou extraordinaire pour rattraper la partie non validée.

b) Travaux pratiques en laboratoire : 20 % de la note finale.

c) Travaux réalisés par l'étudiant : 10 %.

Pour valider le cours, il est nécessaire d’obtenir 5/10 points.

Session ordinaire : l’étudiant qui n’obtient pas 5/10 points au cours de l’année devra passer l’examen partiel ou les examens partiels échoués.

Session extraordinaire : l'étudiant qui n'a pas réussi le cours lors de la session ordinaire devra passer l'examen partiel ou les examens partiels auxquels il a échoué lors de la session extraordinaire de juillet.

Calendrier

Cliquez sur ce lien pour obtenir le calendrier détaillé au format Excel

Bibliographie

De base :

1.- Benito Jiménez, César

360 problèmes de génétique :

: Síntesis. 1999.

ISBN : 8477385327

2.- Benito, Espino

Génétique. Concepts essentiels

Panamericana. 2013.

ISBN : 9788498354072

3.- Griffiths AJ

Génétique

7e éd. Madrid [etc.] : McGraw-Hill Interamericana, 2002. 2002.

ISBN : 8448603680

4.- Klug WS

Notions de génétique

8e éd. Pearson. 2006.

ISBN : 8420550140

5.- Ménsua Fernández, José Luis

Génétique

: Pearson Educación. 2003.

ISBN : 8420533416

6.- Pierce BA

Génétique. Une approche conceptuelle

PANAMERICANA (3e éd.). 2009.

ISBN : 9788498352160

Objectifs

L'objectif principal de ce cours est d'intégrer les connaissances relatives au domaine de l'immunologie dans celui de la biotechnologie. À cette fin, les objectifs spécifiques sont les suivants :

- Familiariser l'étudiant avec les éléments constitutifs du système immunitaire et leur interaction dans le développement d'une réponse immunitaire.

- Acquérir des connaissances sur les fondements moléculaires et cellulaires des pathologies immunologiques humaines les plus importantes.

- La connaissance des méthodes les plus efficaces de prévention (immunisation passive, vaccins) et de traitement (immunomodulation) des maladies.

- La connaissance et la compréhension des principes des techniques immunologiques de détection et de caractérisation des pathologies mises en œuvre dans les laboratoires cliniques/immunologiques des hôpitaux, des laboratoires pharmaceutiques ou des centres de recherche.

- L'étudiant doit être capable de manipuler avec habileté le matériel de laboratoire en immunologie.

- L'étudiant doit apprendre à utiliser les principales sources bibliographiques.

Compétences

COMPÉTENCES DE BASE :

CB1 : Les étudiants doivent avoir démontré qu’ils possèdent et comprennent des connaissances dans un domaine d’étude qui s’appuie sur les bases de l’enseignement secondaire général et se situe généralement à un niveau qui, bien qu’il s’appuie sur des manuels avancés, inclut également certains aspects nécessitant des connaissances issues de la pointe de leur domaine d’étude.

CB2 : Que les étudiants sachent appliquer leurs connaissances à leur travail ou à leur vocation de manière professionnelle et possèdent les compétences qui s’expriment généralement par l’élaboration et la défense d’arguments ainsi que par la résolution de problèmes dans leur domaine d’étude.

CB3 : Que les étudiants soient capables de collecter et d’interpréter des données pertinentes (généralement dans leur domaine d’étude) afin de formuler des jugements incluant une réflexion sur des questions pertinentes d’ordre social, scientifique ou éthique.

CB4 : Que les étudiants soient capables de transmettre des informations, des idées, des problèmes et des solutions à un public tant spécialisé que non spécialisé.

CB5 : Que les étudiants aient développé les aptitudes d’apprentissage nécessaires pour entreprendre des études supérieures avec un haut degré d’autonomie.

COMPÉTENCES GÉNÉRALES :

CG1 – Capacité à penser de manière intégrée, à raisonner de façon critique et à aborder les problèmes sous différents angles. /GC1 - Capacité à penser de manière multidimensionnelle, à développer un esprit critique et à aborder les problèmes sous différents angles.

CG2 – Savoir collecter, traiter, interpréter, analyser et synthétiser des informations et des résultats pertinents, et tirer des conclusions sur des thèmes liés à la biotechnologie. / GC2 – Être capable de collecter, traiter, interpréter, analyser et synthétiser des informations et des résultats pertinents, ainsi que de tirer des conclusions sur des questions liées à la biotechnologie.

CG3 – Être capable d’utiliser des sources d’information internationales, ainsi que de communiquer dans une deuxième langue d’importance internationale. / GC3 – Capacité à accéder à des sources d’information internationales et à les utiliser, ainsi qu’à communiquer dans une langue étrangère pertinente.

CG4 - Interpréter des résultats expérimentaux et identifier les éléments cohérents et incohérents. / GC4 - Capacité à interpréter des résultats expérimentaux et à identifier les éléments cohérents et incohérents.

CG5. – Appliquer les connaissances théoriques et pratiques acquises à la formulation de problèmes et rechercher des solutions de manière efficace et créative, tant dans des contextes professionnels qu’académiques. / GC5 – Capacité à appliquer les connaissances théoriques et pratiques acquises à la résolution de problèmes et à trouver des solutions efficaces et créatives dans des contextes tant professionnels qu’académiques.

CG6. – Capacité à assimiler de nouveaux concepts et à apprendre de manière autonome, à organiser et planifier son travail, ainsi qu’à acquérir la capacité de travailler en équipe et la confiance en soi. / GC6 - Capacité à assimiler de nouveaux concepts et à apprendre de manière autonome, à organiser et planifier son propre travail, ainsi qu’à travailler en équipe avec confiance en soi.

COMPÉTENCES SPÉCIFIQUES :

CE2. – Capacité à travailler correctement en laboratoire en appliquant les principes de base en matière de sécurité, de manipulation et d’élimination des déchets, et en tenant un registre détaillé des activités. / SC2 - Être capable de travailler correctement en laboratoire, c'est-à-dire en appliquant les principes de base de la manipulation et de l'élimination des déchets, de la sécurité, et en tenant systématiquement un registre des activités.

CE15.- Distinguer les types de réponses immunitaires et la fonction des cellules impliquées ; savoir mettre en œuvre les techniques immunologiques de base et interpréter les résultats obtenus, ainsi que connaître les applications biotechnologiques fondées sur l’utilisation d’anticorps. / SC15 - Être capable d’identifier les différents types de réponses immunitaires et la fonction des cellules impliquées ; savoir mettre en œuvre les techniques immunologiques de base et interpréter les résultats obtenus, ainsi que connaître les applications biotechnologiques liées à l’utilisation d’anticorps.

Résultats d'apprentissage

• Acquérir des connaissances théoriques et pratiques sur les fondements génétiques et moléculaires du système immunitaire.

• Identifier les cellules immunitaires et établir un lien entre leurs fonctions et les réponses immunitaires.

• Distinguer la réponse immunitaire innée de la réponse immunitaire adaptative.

• Identifier les organes impliqués dans la réponse immunitaire et leurs fonctions.

Description du contenu

PROGRAMME DES COURS DE MASTER :

PHYSIOLOGIE DU SYSTÈME IMMUNITAIRE

Leçon 1. INTRODUCTION À L'IMMUNOLOGIE

Leçon 2. LES COMPOSANTS DU SYSTÈME IMMUNITAIRE

Leçon 3. IMMUNITÉ INNÉE CONTRE LES AGENTS PATHOGÈNES EXTRACELLULAIRES ET INTRACELLULAIRES

Leçon 4. IMMUNITÉ ADAPTATIVE I : RECONNAISSANCE DES ANTIGÈNES

Leçon 5. IMMUNITÉ ADAPTATIVE II : GÉNÉRATION ET MATURATION DES CELLULES T ET B

Leçon 6. IMMUNITÉ ADAPTATIVE III : ACTIVATION ET FONCTION DES CELLULES LYMPHOÏDES

IMMUNOPATHOLOGIE : BASES CELLULAIRES ET MOLÉCULAIRES

Leçon 7. ANOMALIES DU SYSTÈME IMMUNITAIRE : IMMUNODÉFICIENCES

Leçon 8. RÉACTION EXCESSIVE : HYPERSENSIBILITÉ ET ALLERGIE

Leçon 9. DÉFAILLANCES DU SYSTÈME IMMUNITAIRE : AUTO-IMMUNITÉ

Leçon 10. RÉPONSE IMMUNITAIRE CONTRE LES TUMEURS

TECHNIQUES IMMUNOLOGIQUES ET BIOTECHNOLOGIE

Leçon 11. IMMUNISATION ARTIFICIELLE : IMMUNISATION PASSIVE ET VACCINS.

Leçon 12. MODULATION DU SYSTÈME IMMUNITAIRE : TRANSPLANTATIONS

COMPLÉMENT AUX COURS DE MASTER :

Différentes sessions consacrées à des thèmes spécifiques du système immunitaire :

- Les cytokines et la modulation immunitaire

- L'inflammation : rôle central dans différentes réponses immunitaires

- Le SARS-CoV-2 et le système immunitaire

- Mécanismes de défense des agents pathogènes contre le système immunitaire

- Modulation du système immunitaire pendant la grossesse

SÉMINAIRES :

Travaux réalisés par les étudiants sur différents aspects du système immunitaire

Le travail sera divisé en trois parties :

Présentation orale (avec PowerPoint/Prezi/Keynote…)

Bref résumé de l'exposé (document Word de 4 à 5 pages)

2 questions à choix multiples (similaires à celles de l'examen de mi-semestre)

La note obtenue par l'étudiant lors du séminaire représente 15 % de la note finale de la matière

COURS PRATIQUES :

Les travaux pratiques auront lieu une fois par semaine

Deux groupes/horaires différents : 14 h 30 - 17 h 30 et 17 h 30 - 20 h 30

4 travaux pratiques (du lundi au jeudi) :

Évaluation de l'activité hémolytique du complément (CH50)

Isolement des leucocytes

Détermination de l'antigène par test ELISA

Détection d'anticorps par immunofluorescence indirecte (IIF)

1 examen de laboratoire (vendredi) :

Cette note représente 15 % de la note finale de la matière

Activités pédagogiques

Cours magistral/Séances (SÉANCE dans le calendrier)

Travaux pratiques (LB dans le calendrier)

Séminaires/Travaux (TRAB dans le calendrier)

Tutorats/Consultations/Compléments aux cours magistraux (CN dans le calendrier)

Évaluation (EV dans le calendrier)

Étude personnelle

Système et critères d'évaluation

Sans préjudice de l'éventuelle définition d'une autre exigence dans le programme de cours correspondant, de manière générale, l'absence à plus de 70 % des activités pédagogiques du cours, nécessitant la présence physique ou virtuelle de l'étudiant, entraînera la perte du droit à l'évaluation continue lors de la session ordinaire. Dans ce cas, l’examen qui se tiendra pendant la période officielle fixée par l’université constituera le seul critère d’évaluation, avec la pondération qui lui correspond selon le programme de la matière.

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A) 2 évaluations intermédiaires à réaliser en ligne en classe

Caractéristiques de l'évaluation intermédiaire :

- Épreuve à choix multiples

- 30 questions (5 réponses, dont 1 correcte pour chacune)

20 réponses correctes sont nécessaires pour réussir l'examen. Une fois l'examen réussi, le sujet correspondant est retiré de l'examen de session

B) Session ordinaire :

À passer en ligne en classe

Caractéristiques :

Épreuve à choix multiples

30 questions (5 réponses, dont 1 correcte pour chacune) pour les étudiants n’ayant passé qu’un seul examen intermédiaire. 20 réponses correctes sont nécessaires pour réussir l’examen

50 questions (5 réponses possibles, dont 1 correcte pour chacune) pour les étudiants ayant suivi l'intégralité du programme ; 30 réponses correctes sont requises pour réussir l'examen

La note finale de la matière, à condition que la partie théorique ait été validée, se calcule comme suit : 70 % de la note obtenue à la partie théorique + 15 % de l'examen pratique + 15 % de la note du séminaire

Calendrier

Cliquez sur ce lien pour obtenir le calendrier détaillé au format Excel

Bibliographie

De base :

1.- Abbas MBBS, Abul K. ; Lichtman MD PhD, Andrew H

Immunologie cellulaire et moléculaire (10e édition)

Elsevier. 2021.

ISBN : 9780323757485

2.- Murphy, K. — Weaver, C.

L'immunobiologie de Janeway

Éditions NORTON MEDICAL BOOKS. 2017.

ISBN : 9780815345510

3.- Peter J. Delves, Seamus J. Martin, Dennis R. Burton, Ivan M. Roitt

L'immunologie essentielle de Roitt, 13e édition

Wiley. 2017.

ISBN : 9781118415771

Objectifs

Initiation à l'étude de la structure des composés organiques, à leurs systèmes de nomenclature et aux concepts fondamentaux de la chimie du vivant, en vue d'acquérir les compétences suivantes :

CONNAISSANCES

• Maîtriser la nomenclature et la symbologie utilisées en chimie organique.

• Connaître la structure, la nomenclature et la réactivité des principaux composés organiques.

• Bien comprendre le concept de chiralité et la conformation des molécules organiques.

• Comprendre les principes fondamentaux des mécanismes des réactions organiques.

• Bien comprendre les fondements de la structure et de la réactivité des principales biomolécules.

COMPÉTENCES

• Écrire les formules chimiques des composés organiques d’importance biologique et évaluer leurs principales caractéristiques de réactivité en les associant à leurs propriétés structurelles.

• Appliquer les concepts de stéréochimie et de chiralité à des biomolécules simples.

• Établir un lien entre les différents mécanismes de réactions organiques et les processus biologiques

Compétences

COMPÉTENCES DE BASE

CB1 : Les étudiants doivent avoir démontré qu’ils possèdent et comprennent des connaissances dans un domaine d’étude qui s’appuie sur les bases de l’enseignement secondaire général et se situe généralement à un niveau qui, bien qu’il s’appuie sur des manuels avancés, inclut également certains aspects nécessitant des connaissances issues de la pointe de leur domaine d’étude.

CB2 : Les étudiants doivent savoir appliquer leurs connaissances à leur travail ou à leur vocation de manière professionnelle et posséder les compétences qui s’expriment généralement par l’élaboration et la défense d’arguments ainsi que par la résolution de problèmes dans leur domaine d’étude.

CB3 : Que les étudiants soient capables de collecter et d’interpréter des données pertinentes (généralement dans leur domaine d’étude) afin de formuler des jugements incluant une réflexion sur des questions pertinentes d’ordre social, scientifique ou éthique.

CB4 : Que les étudiants soient capables de transmettre des informations, des idées, des problèmes et des solutions à un public tant spécialisé que non spécialisé.

CB5 : Que les étudiants aient développé les aptitudes d’apprentissage nécessaires pour entreprendre des études supérieures avec un haut degré d’autonomie.

COMPÉTENCES GÉNÉRALES

CG1 – Penser de manière intégrée, raisonner de manière critique et aborder les problèmes sous différents angles.

CG2 – Savoir obtenir, traiter, interpréter, analyser et synthétiser des informations et des résultats pertinents, et tirer des conclusions sur des thèmes liés à la biotechnologie.

CG4 - Interpréter des résultats expérimentaux et identifier les éléments cohérents et incohérents.

CG5. – Appliquer les connaissances théoriques et pratiques acquises à la formulation de problèmes et rechercher des solutions de manière efficace et créative, tant dans des contextes professionnels qu’académiques.

CG6. – Étudier et apprendre de manière autonome, en organisant et en planifiant son travail, et acquérir la capacité de travailler en équipe ainsi que la confiance en soi.

COMPÉTENCES SPÉCIFIQUES

CE1. – Connaître et comprendre les concepts fondamentaux des mathématiques, de la physique, de la chimie et de la biologie, ainsi que les principaux outils utilisés dans ces disciplines pour la recherche et le développement de procédés biotechnologiques.

CE2. – Travailler de manière appropriée en laboratoire en appliquant les principes fondamentaux de sécurité, de manipulation et d’élimination des déchets, et en tenant un registre détaillé des activités.

CE3 - Connaître les principales transformations des biomolécules, tant dans les produits naturels que dans leurs dérivés industriels, et savoir mener à bien des réactions chimiques présentant un intérêt biotechnologique à l'échelle du laboratoire ou à l'échelle industrielle.

Résultats d'apprentissage

- Savoir reconnaître les groupes fonctionnels d’un composé organique ou d’une molécule biochimique.

- Comprendre la structure tridimensionnelle des molécules et ses implications.

- Capacité à concevoir/interpréter des transformations chimiques de composés organiques présentant un intérêt en biotechnologie.

- Établir une corrélation entre la structure des composés organiques et biochimiques et leurs propriétés physiques, leur réactivité et leur stabilité.

-Comprendre la relation structure-activité (RSA) des composés organiques présentant un intérêt biochimique, pharmacologique et/ou environnemental.

- Connaître les procédés de laboratoire nécessaires à la transformation, à la séparation, à l’isolement et à la purification des composés organiques, en évaluant les risques potentiels associés.

- Capacité à appliquer les connaissances acquises en théorie et lors des travaux pratiques de laboratoire à la résolution de problèmes et de questions liés aux composés organiques.

-Rédaction de rapports, de résumés et de présentations sur des travaux bibliographiques ou expérimentaux, en faisant preuve d’esprit critique et d’autocritique.

Description des contenus

THÈME 1. Introduction et concepts généraux.

THÈME 2. NOMENCLATURE DES HYDROCARBURES

2.1. Nomenclature des alcanes et des cycloalcanes.

2.2. Nomenclature des alcènes et des alcynes.

2.3. Nomenclature des hydrocarbures aromatiques : benzène et dérivés.

THÈME 3. ISOMÉRIE. STÉRÉOCHIMIE

3.1. Isomères structuraux.

3.2. Isomères spatiaux. Stéréoisomérie.

3.2.1. Diastereoisomères.

3.2.1.1. Isomères géométriques cis-trans et E-Z.

3.2.2. Énanchiomères ou isomères optiques.

THÈME 4. NOMENCLATURE DES GROUPES FONCTIONNELS.

4.1. Nomenclature des alcools, des phénols et des éthers.

4.2. Nomenclature des aldéhydes et des cétones.

4.3. Nomenclature des acides carboxyliques et de leurs dérivés.

4.4. Nomenclature des composés azotés.

THÈME 5. RÉACTIONS DE BASE DES GROUPES FONCTIONNELS ET LEURS MÉCANISMES.

5.1. Concepts généraux.

5.2. Réactions des alcanes

5.3. Réactions des alcènes.

5.4. Réactions de cycloaddition. Systèmes allyliques et diènes conjugués.

5.5. Réactions des alcynes.

5.6. Réactions des dérivés halogénés. Réactions de substitution et d'élimination.

5.7. Réactions du groupe carbonyle.

5.8. Réactions du groupe carboxylique.

5.9. Réactions nucléophiles des anions énolates.

THÈME 6. RÉACTIONS DE SUBSTITUTION ÉLECTROPHILE AROMATIQUE.

6.1. Réactions de substitution de base.

6.2. Mécanismes de réaction.

6.3. Réactivité et orientation des benzènes substitués.

6.4. Réactions de substitution nucléophile aromatique.

THÈME 7. GROUPES PROTECTEURS DES PRINCIPAUX GROUPES FONCTIONNELS.

7.1. Groupes protecteurs des alcools et des diols.

7.2. Groupes protecteurs des aldéhydes et des cétones.

7.3. Groupes protecteurs des acides carboxyliques.

7.4. Groupes protecteurs des amines.

Activités de formation

Cours magistraux/Séances (SÉANCE dans le calendrier)

Travaux pratiques (LB dans le calendrier)

Séminaires/Travaux (TRAB dans le calendrier)

Tutorats/Consultations/Compléments aux cours magistraux (CN dans le calendrier)

Évaluation (EV dans le calendrier)

Étude personnelle

Système et critères d'évaluation

Sans préjudice de l'éventuelle définition d'une autre exigence dans le programme de cours correspondant, de manière générale, l'absence à plus de 70 % des activités pédagogiques du cours, nécessitant la présence physique ou virtuelle de l'étudiant, entraînera la perte du droit à l'évaluation continue lors de la session ordinaire. Dans ce cas, l’examen qui se tiendra pendant la période officielle fixée par l’université constituera le seul critère d’évaluation, avec la pondération qui lui est attribuée conformément au programme de la matière.

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Épreuve d'évaluation finale en présentiel

Participation aux forums et autres supports participatifs : elle est évaluée en tenant compte de l’utilisation et de la participation de l’étudiant aux sessions en présentiel ou en ligne, aux ateliers, aux forums, etc.

Épreuve d’évaluation des travaux pratiques : destinée à mettre en pratique les concepts étudiés dans chaque cours. L’évaluation de ces connaissances a lieu à la fin du cours, en présentiel.

Séminaires : ce critère prend en compte les activités que l’étudiant envoie via la plateforme d’apprentissage en ligne (devoirs, projets, études de cas) ainsi que les exposés en classe

Calendrier

Cliquez sur ce lien pour obtenir le calendrier détaillé au format Excel

Bibliographie

De base :

1.- David Klein

Chimie organique

Panamericana. 2014.

ISBN : 9788498351699

2.- Ege

Chimie organique

Reverté. 2000.

ISBN : 8429170650

3.- García, F. ; Dobado, J. A.

Problèmes résolus de chimie organique

Paraninfo. 2007.

ISBN : 8497324587

4.- McMurry, John

Chimie générale

Mexique : Pearson Educación, 2009. 2009.

ISBN : 9780131993235

5.- Quiñoá Cabana, Emilio

Questions et exercices de chimie organique : un guide d'étude

Madrid : McGraw-Hill Interamericana d'Espagne, 200. 2004.

ISBN : 844814015X

6.- Quiñoá, Emilio

Nomenclature et formulation des composés inorganiques : U

Madrid [etc.] : McGraw-Hill, 2006. 2006.

ISBN : 8448146255

7.- Solomons, T. W. Graham

Chimie organique

Mexico : Limusa Wiley, 2000. 2000.

ISBN : 9681852176

8.- Solomons, T. W. Graham

Chimie organique : guide d'étude et corrigés

Mexico : Limusa Wiley, 1999. 1999.

ISBN : 9681845609

9.- Vollhardt, K. Peter C.

Chimie organique : structure et fonction

Barcelone : Omega, 2000. 2000.

ISBN : 8428211728

Complémentaire :

10.- Carey, Francis A.

Chimie organique

Madrid [etc.] : McGraw-Hill, 1999. 1999.

ISBN : 844812426X

11.- Isac-García

Chimie organique expérimentale

Elsevier. 2015.

ISBN : 9780128038932

12.- Wade, L.G.

Chimie organique

Pearson Prentice Hall. 2004.

ISBN : 8420541028

13.- Warren, Stuart

Manuel de solutions accompagnant le cours de chimie organique

Oxford : Oxford University Press, 2001. 2001.

ISBN : 0198700385

Objectifs

- Connaître et comprendre les différents principes fondamentaux qui sous-tendent les techniques instrumentales.

- Démontrer sa connaissance du fonctionnement des instruments d'analyse de base.

- Acquérir la capacité à manipuler les différents instruments et à régler les paramètres instrumentaux, ainsi qu’à obtenir le plus grand nombre d’informations fiables à partir des données expérimentales.

- Acquérir une maîtrise des techniques instrumentales les plus couramment utilisées en biotechnologie et savoir choisir celles qui conviennent le mieux à un processus biotechnologique spécifique.

- Comprendre les techniques de biomarquage.

Compétences

COMPÉTENCES DE BASE :

CB1 : Les étudiants doivent avoir démontré qu’ils possèdent et comprennent des connaissances dans un domaine d’étude qui s’appuie sur les bases de l’enseignement secondaire général et se situe généralement à un niveau qui, bien qu’il s’appuie sur des manuels avancés, inclut également certains aspects nécessitant des connaissances issues de la pointe de leur domaine d’étude.

CB2 : Les étudiants doivent savoir appliquer leurs connaissances à leur travail ou à leur vocation de manière professionnelle et posséder les compétences qui s’expriment généralement par l’élaboration et la défense d’arguments ainsi que par la résolution de problèmes dans leur domaine d’étude.

CB3 : Que les étudiants soient capables de collecter et d’interpréter des données pertinentes (généralement dans leur domaine d’étude) afin de formuler des jugements incluant une réflexion sur des questions pertinentes d’ordre social, scientifique ou éthique.

CB4 : Que les étudiants soient capables de transmettre des informations, des idées, des problèmes et des solutions à un public tant spécialisé que non spécialisé.

CB5 : Que les étudiants aient développé les aptitudes d’apprentissage nécessaires pour entreprendre des études supérieures avec un haut degré d’autonomie.

COMPÉTENCES GÉNÉRALES :

CG1 : Penser de manière intégrée, raisonner de façon critique et aborder les problèmes sous différents angles.

CG2 : Savoir obtenir, traiter, interpréter, analyser et synthétiser des informations et des résultats pertinents, et tirer des conclusions sur des thèmes liés à la biotechnologie.

CG4 : Interpréter des résultats expérimentaux et identifier les éléments cohérents et incohérents.

CG5 : Appliquer les connaissances théoriques et pratiques acquises à la formulation de problèmes et rechercher des solutions de manière efficace et créative, tant dans des contextes professionnels qu’académiques.

CG6 : Étudier et apprendre de manière autonome, en organisant et en planifiant son travail, et acquérir la capacité de travailler en équipe ainsi que la confiance en soi.

COMPÉTENCES SPÉCIFIQUES :

CE2 : Travailler de manière appropriée en laboratoire en appliquant les principes de base de sécurité, de manipulation et d’élimination des déchets, et en tenant un registre détaillé des activités.

CE8 : Connaître et savoir appliquer les techniques instrumentales et les protocoles de travail dans les laboratoires de biotechnologie, ainsi qu’acquérir des compétences dans la manipulation des équipements.

Résultats d'apprentissage

• Connaître et comprendre les différents principes fondamentaux qui sous-tendent les techniques instrumentales.

• Démontrer sa connaissance du fonctionnement des instruments d’analyse de base.

• Acquérir la capacité à utiliser les différents instruments et à régler les paramètres instrumentaux, ainsi qu’à obtenir le plus d’informations fiables possible à partir des données expérimentales.

• Acquérir une maîtrise des techniques instrumentales les plus couramment utilisées en biotechnologie et savoir choisir celles qui conviennent le mieux à un processus biotechnologique spécifique.

• Décrire les fondements théoriques des techniques de base d’obtention et de caractérisation des biomolécules.

Description du contenu

1. Introduction aux techniques instrumentales

2. Techniques optiques

- Spectroscopie de flamme. ICP-OES

- Spectroscopie d'absorption UV-Vis

- Spectroscopie de fluorescence et de phosphorescence

- Turbidimétrie

- Autres techniques non spectroscopiques

3. Essais enzymatiques

4. Marquage radioactif des biomolécules

5. Électrochimie

- Potentiométrie

- Voltamétrie

6. Capteurs et biocapteurs

7. Centrifugation

- Ultracentrifugation

LABORATOIRES :

- Spectroscopie UV-Vis

- Potentiométrie

- Centrifugation

Activités de formation

Cours magistral/Séances (SÉANCE dans le calendrier)

Travaux pratiques (LB dans le calendrier)

Séminaires/Travaux (TRAB dans le calendrier)

Tutorats/Consultations/Compléments aux cours magistraux (CN dans le calendrier)

Évaluation (EV dans le calendrier)

Étude personnelle

Système et critères d'évaluation

Sans préjudice de l'éventuelle définition d'une autre exigence dans le programme de cours correspondant, de manière générale, l'absence à plus de 70 % des activités pédagogiques du cours, nécessitant la présence physique ou virtuelle de l'étudiant, entraînera la perte du droit à l'évaluation continue lors de la session ordinaire. Dans ce cas, l’examen qui se tiendra pendant la période officielle fixée par l’université constituera le seul critère d’évaluation, avec la pondération qui lui correspond selon le programme de la matière.

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1. Épreuves partielles - 70 %

- Premier examen partiel : 35 % (compense une note de 5,0 et libère une note de 6,5)

- Deuxième examen partiel : 35 % (compense une note de 5,0 et libère une note de 6,5)

2. Travaux pratiques - 15 %

3. Devoirs - 15 %

Calendrier

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Bibliographie

de base :

1.- Skoog, Douglas A.

Principes d'analyse instrumentale

Madrid [etc.] : McGraw-Hill, 2000. 2000.

ISBN : 8448127757

Objectifs

1. Connaître et expliquer les principales voies de signalisation intervenant dans les processus de développement.

2. Connaître les étapes et les facteurs intervenant dans les processus de gamétogenèse et de sporogenèse.

3. Connaître les étapes et les facteurs intervenant dans les processus de fécondation et d’implantation.

4. Connaître les processus impliqués dans le développement embryonnaire précoce.

5. Connaître les processus impliqués dans la formation du plan corporel au cours du développement, de la morphogenèse et de l'organogenèse.

6. Connaître et comprendre les mécanismes qui interviennent dans la régénération des tissus.

7. Connaître les caractéristiques et les fonctions des tissus animaux et végétaux.